解析卷积神经网络在药物研发中的应用

樱花飘落 2021-03-19 ⋅ 9 阅读

人工智能(Artificial Intelligence,AI)在许多领域都表现出了巨大的潜力,其中在药物研发领域,卷积神经网络(Convolutional Neural Networks,CNN)正逐渐展现出其重要性。CNN通过模拟人类视觉系统中的处理方式,能够有效地提取特征,并在药物研发中扮演关键的角色。本文将对CNN在药物研发中的应用进行详细解析。

1. 药物活性预测

药物活性预测是药物研发过程中重要的一步,旨在预测分子与靶点的相互作用强度。CNN能够根据药物的结构信息和靶点的序列信息,有效地学习并预测分子活性。通过将药物的结构表示为分子图或SMILES表示法,将靶点的氨基酸序列表示为编码后的序列,结合CNN的卷积和池化操作,可以提取并组合特征,从而准确地预测药物与靶点之间的相互作用。

2. 药物分子生成

药物研发中,寻找新的分子结构是一个重要且具有挑战性的任务。CNN可以通过学习大量已知药物的结构信息,在生成新药物时提供有效的引导。通过将药物的结构表示为分子图,将CNN应用于分子生成任务中可以生成符合特定目标的药物候选化合物。由于CNN能够掌握分子结构的局部和全局特征,因此可生成具有较高结构多样性和药物性能的分子。

3. 药物副作用预测

在药物研发过程中,预测和评估药物的副作用是一项重要任务,可帮助选择和优化药物候选化合物。CNN可以通过学习药物分子的结构特征和与副作用相关的目标蛋白质序列信息,预测药物的副作用。通过将药物分子的结构表示为分子图,将目标蛋白质序列表示为编码后的序列,在CNN中进行特征提取和组合,可以准确预测药物的副作用。

4. 药物靶点识别

药物研发中,了解药物与特定靶点的相互作用是关键的一步。CNN可以通过学习已知的药物-靶点关系,从未知药物中识别出与特定靶点相关的药物。通过将药物的结构表示为分子图,将靶点的氨基酸序列表示为编码后的序列,在CNN中进行特征提取和组合,可以高效地识别出药物与特定靶点之间的亲和性。

综上所述,CNN在药物研发中具有广泛的应用前景。通过利用CNN的卓越特性,可以提高药物活性预测的准确度,加速药物分子的生成,预测药物的副作用以及识别药物与靶点的相互作用。随着人工智能技术的不断发展,相信CNN在药物研发中的应用将成为未来的重要趋势。

参考文献: [1] Wallach, I., Dzamba, M., & Heifets, A. (2015). AtomNet: A Deep Convolutional Neural Network for Bioactivity Prediction in Structure-based Drug Discovery. arXiv preprint arXiv:1510.02855. [2] Goh, G. B., Siegel, C., Vishnu, A., & Hodas, N. O. (2017). SMILES2Vec: An Interpretable General-purpose Deep Neural Network for Predicting Chemical Properties. arXiv preprint arXiv:1712.02034. [3] Zhou, Z., & Li, X. B. (2019). Deep reinforcement learning-based drug discovery: a review. arXiv preprint arXiv:1907.00813.


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